278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1346 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 334 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  74.45 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  40.13 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  39.81 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  39.48 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  39.48 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  39.48 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  39.48 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  39.81 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  39.16 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  38.83 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  39.16 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  42.63 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  45.3 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  28.4 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  26.69 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  26.22 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  27.35 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  28.48 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  27.08 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  29.69 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  27.36 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  27.47 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  27.16 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  29.01 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  27.11 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  26.79 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  28.41 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  25.84 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  29.1 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  26.07 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  27.83 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  27.11 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  25.84 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  28.79 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  26.85 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  27.19 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  24.62 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  26.55 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  28.36 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  24.85 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  28.62 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  28.36 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  27.55 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  30.9 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  27.82 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  27.96 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.45 
 
 		 346 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.53 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.45 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  25.45 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  25.45 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  28.7 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  25.45 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  26.14 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  25.45 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  28.27 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  31.48 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  28.47 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  27.4 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  26.07 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  29.75 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  31.08 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  28.74 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  24.69 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  25.9 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  26.81 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  26.24 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  23.93 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  31.32 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  27.36 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.87 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  31.6 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  30.43 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  31.36 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  32.14 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  31.08 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.05 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  28.08 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  31.82 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  32.01 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  23.42 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  26.14 
 
 		 384 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  29.34 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  29.51 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  26.81 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  26.59 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  26.44 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  29.97 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.99 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  26.38 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  27.21 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 349 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  26.22 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>