17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0557 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 675 aa  1356    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  55.02 
 
 		 682 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  47.32 
 
 		 685 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  28.36 
 
 		 690 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  25.05 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  22.8 
 
 		 721 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  27.42 
 
 		 754 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  24.75 
 
 		 773 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  27.79 
 
 		 770 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  23.97 
 
 		 702 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  22.74 
 
 		 704 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  26.29 
 
 		 705 aa  87.4  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  23.93 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  23.7 
 
 		 718 aa  52.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  28.28 
 
 		 663 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5720  hypothetical protein  23.43 
 
 		 174 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  33.75 
 
 		 678 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>