27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5275 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  205  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  56.92 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  54.1 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  41 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  50 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  50 
 
 		 272 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  48.44 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  48.33 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  44.44 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  48.33 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  46.67 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  46.67 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  46.67 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  44 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  47.69 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  43.33 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  44.83 
 
 		 288 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  46.55 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  40.28 
 
 		 290 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  41.38 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  38.16 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  38.1 
 
 		 279 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  42.86 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>