13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4061 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  453  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.78 
 
 
218 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  38.05 
 
 
212 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.69 
 
 
222 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.27 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  27 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.61 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  27.63 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.85 
 
 
747 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  26.55 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.62 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  26.57 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>