More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3437 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3437  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
498 aa  998    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0110073  hitchhiker  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  43.41 
 
 
496 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  42.66 
 
 
497 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  44.18 
 
 
498 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  43 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  46.88 
 
 
520 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  47.25 
 
 
507 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  44.85 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  43.06 
 
 
504 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  46.37 
 
 
499 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  41.8 
 
 
496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  42.08 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  43.29 
 
 
496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  41.8 
 
 
496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  43.86 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  41.8 
 
 
496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  41.6 
 
 
496 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  41.8 
 
 
496 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  42.48 
 
 
498 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  42.48 
 
 
501 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  41.6 
 
 
496 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  42.74 
 
 
507 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  44.27 
 
 
494 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  43.15 
 
 
505 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  45.12 
 
 
501 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  43.66 
 
 
494 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  41.8 
 
 
496 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  42.48 
 
 
498 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  44.06 
 
 
494 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  41.4 
 
 
496 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  45.88 
 
 
496 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  41.4 
 
 
496 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  42.74 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  43.26 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  42.86 
 
 
505 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  46.26 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  43.46 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  44.06 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  43.75 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  42.74 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  42.94 
 
 
505 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  43.32 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  43.66 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  44.35 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  42.74 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  44.06 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  46.54 
 
 
496 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  42.54 
 
 
499 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  42.74 
 
 
501 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3313  carbohydrate kinase FGGY  44.74 
 
 
501 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000213969  normal  0.0641237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  42.94 
 
 
503 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  42.86 
 
 
503 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  42.74 
 
 
500 aa  436  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  42.83 
 
 
498 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  43.75 
 
 
505 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  42.11 
 
 
499 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  42.45 
 
 
502 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  42.48 
 
 
498 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  42.89 
 
 
513 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  43.75 
 
 
505 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  44.96 
 
 
496 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  45.33 
 
 
505 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  43.89 
 
 
496 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  42.57 
 
 
501 aa  437  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  43.03 
 
 
496 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  40.6 
 
 
499 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  45.16 
 
 
497 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  42.54 
 
 
501 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  47.39 
 
 
497 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  41.7 
 
 
499 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  41.73 
 
 
493 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  45.16 
 
 
510 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  42.14 
 
 
499 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  41.85 
 
 
502 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  41.94 
 
 
501 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  43.32 
 
 
498 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  43.81 
 
 
495 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  45.16 
 
 
497 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  41.37 
 
 
494 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  43.71 
 
 
497 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  42.14 
 
 
500 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  41.73 
 
 
503 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  44.6 
 
 
495 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  44.64 
 
 
501 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  41.28 
 
 
500 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  41.08 
 
 
500 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>