182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3137 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3137  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.180684  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  44.53 
 
 		 277 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.94 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  43.87 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.73 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  44.06 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  40.23 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  40.23 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  37.93 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  35.42 
 
 		 340 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.12 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.1 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.15 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.67 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  31.52 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.84 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  33.59 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.44 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.34 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.46 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  31.55 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  27.17 
 
 		 356 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.88 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.97 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.92 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.17 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  35.34 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.51 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  33.72 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  27.99 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  33.08 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  31.13 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  30.8 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  28.1 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  33.33 
 
 		 617 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  28.05 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  31.62 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.91 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  30.95 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04680  siderophore-interacting protein  33.17 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4105  Siderophore-interacting protein  29.9 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779952  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.79 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  29.1 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.74 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  30.74 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  31.32 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  28.9 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.8 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  30.5 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  29.96 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.74 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2496  siderophore-interacting protein  31.03 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  32.45 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  34.85 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.37 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  31.58 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.64 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  31.97 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  30.51 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.99 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.43 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  32.51 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  28.4 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26750  siderophore-interacting protein  30.53 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.27893  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  27.36 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  30.5 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  30.3 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  29.55 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  30.89 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  29.38 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.89 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.84 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  25.47 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.84 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  29.81 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  28.95 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.02 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  29.69 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  30.74 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  28.73 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.62 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  30.04 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.93 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  28.36 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.41 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  28.36 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  29.01 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  30.12 
 
 		 623 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.24 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  29.09 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.63 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>