More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1834 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
591 aa  1216    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  60.69 
 
 
620 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  57.74 
 
 
586 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  36.28 
 
 
712 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  35.94 
 
 
716 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.36 
 
 
544 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  38.22 
 
 
737 aa  213  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.78 
 
 
718 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  32.59 
 
 
741 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
1129 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  36.73 
 
 
749 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
1231 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  34.03 
 
 
664 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  38.35 
 
 
740 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.75 
 
 
702 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  37.37 
 
 
664 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.63 
 
 
834 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.26 
 
 
845 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.63 
 
 
822 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.33 
 
 
831 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.5 
 
 
845 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.88 
 
 
851 aa  187  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  39.3 
 
 
869 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  32.66 
 
 
855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  30.11 
 
 
845 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  32.43 
 
 
699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.89 
 
 
514 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  39.42 
 
 
869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  30.08 
 
 
845 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.68 
 
 
980 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  35.36 
 
 
683 aa  183  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  38.95 
 
 
869 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  37.37 
 
 
773 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
579 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
773 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  28.9 
 
 
788 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  31.9 
 
 
867 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  28.9 
 
 
788 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.81 
 
 
848 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  36.81 
 
 
846 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.81 
 
 
848 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.81 
 
 
848 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.81 
 
 
846 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  36.82 
 
 
909 aa  180  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  37.76 
 
 
848 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  30.48 
 
 
845 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  30.48 
 
 
845 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  37.23 
 
 
666 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  30.48 
 
 
661 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  32.66 
 
 
501 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.09 
 
 
672 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.87 
 
 
696 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.12 
 
 
845 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.23 
 
 
672 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  30.09 
 
 
672 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.33 
 
 
811 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  31.13 
 
 
872 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.29 
 
 
794 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  32.19 
 
 
778 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.52 
 
 
768 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
857 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  37.23 
 
 
658 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.54 
 
 
846 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
1140 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  33.63 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  31.03 
 
 
872 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.05 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
1140 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.73 
 
 
730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  30.8 
 
 
872 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.43 
 
 
730 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  27.87 
 
 
788 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
874 aa  174  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
874 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  34.03 
 
 
729 aa  174  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
874 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
874 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
874 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  28.73 
 
 
899 aa  173  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  29.18 
 
 
899 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  30.8 
 
 
872 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  34.64 
 
 
1140 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.84 
 
 
810 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
547 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  30.08 
 
 
734 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.13 
 
 
734 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  33.95 
 
 
665 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.63 
 
 
930 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.44 
 
 
804 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.83 
 
 
743 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 
657 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  37.8 
 
 
655 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 
657 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  37.4 
 
 
657 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  37.4 
 
 
655 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>