12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1024 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  100 
 
 
2332 aa  4467    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  40.19 
 
 
2148 aa  367  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  36.31 
 
 
980 aa  119  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  31.82 
 
 
845 aa  105  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  32.25 
 
 
738 aa  98.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  31.16 
 
 
804 aa  68.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 
1489 aa  48.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
709 aa  48.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 
816 aa  47.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.33 
 
 
2656 aa  47  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.54 
 
 
1501 aa  46.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
966 aa  45.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>