14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0785 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  44.95 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.31 
 
 
213 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.49 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  35.62 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  31.8 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.28 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.87 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.35 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.33 
 
 
747 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  27.85 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  26.55 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.59 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.17 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>