59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3547 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  93.1 
 
 		 145 aa  270  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  86.21 
 
 		 145 aa  236  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  86.21 
 
 		 145 aa  236  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  85.52 
 
 		 145 aa  233  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  70.83 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  53.47 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  53.1 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  51.72 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  51.03 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  48.28 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  45.89 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  46.21 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  43.15 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  43.15 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  39.44 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  36.43 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  27.07 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  27.13 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  33.09 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  32.37 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  22.46 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  21.74 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  30.21 
 
 		 162 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>