27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3332 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  65.26 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  71.01 
 
 
85 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  74.19 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  75 
 
 
60 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  75 
 
 
60 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  56.92 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  51.52 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  43.94 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  52.73 
 
 
288 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  44.62 
 
 
274 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  48.28 
 
 
280 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  50.91 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  50.91 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  52.73 
 
 
275 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  52.73 
 
 
272 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  50 
 
 
284 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  52.73 
 
 
277 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  49.09 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  48.28 
 
 
290 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  48.28 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  49.09 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  45 
 
 
279 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  46.15 
 
 
307 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>