31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2398 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  91.54 
 
 		 272 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  91.54 
 
 		 272 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  91.54 
 
 		 272 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  95.88 
 
 		 272 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  87.18 
 
 		 270 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  78.97 
 
 		 275 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  77.18 
 
 		 280 aa  377  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  82.35 
 
 		 272 aa  374  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  73 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  65.65 
 
 		 284 aa  358  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  67.16 
 
 		 291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  68.48 
 
 		 290 aa  348  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  73.03 
 
 		 274 aa  333  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  64.71 
 
 		 277 aa  331  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  52.46 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  51.82 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  46.38 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  50.91 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  50.91 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  47.46 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  47.46 
 
 		 85 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  22.78 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  23.5 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  22.48 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>