39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2231 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  52.07 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  41.03 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  42.61 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  41.44 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  36.7 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  41 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  41 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  34.96 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  37.43 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  29.93 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  29.91 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  35.96 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  34.95 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  35.92 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  38.39 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  26.11 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  40.91 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  31.03 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  39.6 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  36.63 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  37.76 
 
 		 102 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  35.42 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  38.75 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  37.76 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2107  hypothetical protein  27.07 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.46407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  24.42 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  29.63 
 
 		 134 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  30.93 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  27.12 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  35.9 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  32.22 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  42.22 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  31.31 
 
 		 133 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  28.85 
 
 		 223 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  44.62 
 
 		 279 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  39.06 
 
 		 272 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>