22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2047 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  54.24 
 
 		 319 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  52.4 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  55.19 
 
 		 297 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  52.75 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  53.7 
 
 		 286 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  49.45 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  49.82 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  50.93 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  50 
 
 		 286 aa  255  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  50 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  49.26 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  50.2 
 
 		 253 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  41.39 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  41.39 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  40.96 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  40.34 
 
 		 240 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  38.78 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  24.11 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11201  conserved hypothetical protein  40.32 
 
 		 376 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  23.1 
 
 		 376 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  25.35 
 
 		 373 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>