17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1874 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.41 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.25 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  55.4 
 
 		 141 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  61.65 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  50.74 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.74 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  37.96 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  37.14 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.67 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.51 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  38.24 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>