27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1535 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 73 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  48.53 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  49.12 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  42.42 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  44.26 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  40.98 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  43.86 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  46 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  38.03 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  34.43 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  45.24 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  42.22 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  43.14 
 
 		 89 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 78 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0915  regulatory protein MerR  42.55 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  41.86 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  36.23 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  38.71 
 
 		 75 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>