140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1473 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  100 
 
 
117 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  43.3 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  51.79 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  45.33 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  45.33 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  50 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  49.23 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  44.62 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  46.55 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  41.38 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  42.24 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.73 
 
 
343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.05 
 
 
341 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.23 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.46 
 
 
348 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 
350 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 
350 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 
350 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  51.28 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3849  ferredoxin  43 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.05965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  43.75 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 
357 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.74 
 
 
348 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  31 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  31 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  43.01 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  31 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  31.37 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 
343 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.89 
 
 
342 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.91 
 
 
338 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  34.04 
 
 
342 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.44 
 
 
340 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.91 
 
 
338 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  48.15 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.65 
 
 
341 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  28.71 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
356 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  28.71 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  28.71 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.93 
 
 
346 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.98 
 
 
343 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.93 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  28 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.17 
 
 
360 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  30.39 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1181  ferredoxin  52.27 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897222  normal  0.136525 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  28.71 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  29 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  37.66 
 
 
379 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.58 
 
 
349 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.62 
 
 
350 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.31 
 
 
382 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  46.15 
 
 
356 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.22 
 
 
338 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.91 
 
 
343 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.11 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.1 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  47.17 
 
 
334 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.47 
 
 
355 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  29.36 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.96 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  29.36 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.03 
 
 
336 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 
337 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  36.36 
 
 
381 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 
342 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.14 
 
 
351 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.94 
 
 
346 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  27.72 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 
380 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 
380 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  32.65 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.54 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.06 
 
 
381 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.03 
 
 
355 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.06 
 
 
380 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.06 
 
 
380 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.06 
 
 
380 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.53 
 
 
349 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.12 
 
 
363 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.33 
 
 
605 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.53 
 
 
349 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  28.12 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.89 
 
 
385 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  25.74 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>