More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0135 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  67.02 
 
 		 458 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 449 aa  920    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 460 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 462 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 491 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 465 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 462 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 493 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 468 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 460 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  44.31 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  45.54 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>