More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1981 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1981  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
446 aa  904    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.568591  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1694  amidophosphoribosyltransferase  58 
 
 
450 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
488 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  44.47 
 
 
469 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  42.14 
 
 
475 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
534 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
480 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  42.73 
 
 
502 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  41.37 
 
 
472 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  40.26 
 
 
558 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
514 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  40.09 
 
 
500 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
515 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  42.67 
 
 
488 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
473 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
515 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
525 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
525 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
513 aa  326  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  41.59 
 
 
477 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
466 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  38.38 
 
 
515 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  41.37 
 
 
477 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
498 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  40.4 
 
 
474 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  38.26 
 
 
517 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
466 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
475 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
482 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  41.81 
 
 
470 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  41.58 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
502 aa  319  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
456 aa  319  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
496 aa  319  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  40.04 
 
 
474 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  39.83 
 
 
478 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  38.88 
 
 
462 aa  319  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
471 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
512 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
465 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
537 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  40.75 
 
 
475 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
468 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
471 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
476 aa  316  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
514 aa  316  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  42.32 
 
 
454 aa  315  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
488 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
511 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
461 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  38.48 
 
 
527 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  37.99 
 
 
505 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  40 
 
 
506 aa  312  7.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  40.13 
 
 
459 aa  312  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  38.23 
 
 
510 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
623 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
474 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  40.27 
 
 
468 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  40 
 
 
526 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  40.89 
 
 
470 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
459 aa  310  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
463 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
514 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  40.13 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  39.14 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
487 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>