17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1704 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.430869  normal  0.452318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1857  conserved hypothetical protein  45.21 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.981135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0162  hypothetical protein  26.82 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0950141  normal  0.439885 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1693  hypothetical protein  30.3 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.502254  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0022  hypothetical protein  31.16 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.556429  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0880  hypothetical protein  31.62 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  30.85 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0714  hypothetical protein  27.34 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.845717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  31.18 
 
 		 153 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  32.22 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  48.94 
 
 		 343 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2235  hypothetical protein  25.64 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  30.43 
 
 		 153 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>