10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0022 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0022  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  395  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.556429  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0714  hypothetical protein  32.79 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.845717  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0880  hypothetical protein  32.33 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1693  hypothetical protein  31.93 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.502254  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2235  hypothetical protein  36.3 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0162  hypothetical protein  25.88 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0950141  normal  0.439885 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1704  hypothetical protein  30.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.430869  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0615  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1857  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.981135  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
107 aa  41.6  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>