30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0266 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0266  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  100 
 
 		 68 aa  146  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00519486  normal  0.318668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1509  zinc finger CDGSH-type domain protein  53.12 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000655444  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1075  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  57.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0134268  normal  0.413778 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0469  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.42 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1316  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.83 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864134  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.29 
 
 		 516 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.59 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  42 
 
 		 515 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  54.55 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.43 
 
 		 516 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1557  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.1 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.159557  normal  0.828081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0138  zinc finger CDGSH-type domain protein  57.58 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.38 
 
 		 516 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  52.94 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.57 
 
 		 514 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0126  zinc finger CDGSH-type domain protein  52.94 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000192409  decreased coverage  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 510 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  41.07 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  77.27 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.31 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.48 
 
 		 502 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.31 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0862  hypothetical protein  47.73 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0041853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  48.48 
 
 		 518 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0104  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.39 
 
 		 74 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  45.45 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2171  hypothetical protein  42.22 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00528546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.48 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>