More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5571 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  78.19 
 
 		 460 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  79.05 
 
 		 460 aa  717    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  82.11 
 
 		 462 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  81.9 
 
 		 462 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  81.9 
 
 		 462 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 465 aa  948    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 458 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 493 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 482 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 474 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 467 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 461 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>