43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4322 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  320  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  63.86 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  76.74 
 
 
154 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  62.65 
 
 
153 aa  177  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  74.42 
 
 
174 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  74.42 
 
 
174 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  59.82 
 
 
183 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  58.04 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  54.62 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  55.26 
 
 
172 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  50.96 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  42.15 
 
 
125 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  52.43 
 
 
139 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  46.02 
 
 
136 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  49.51 
 
 
138 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  45.45 
 
 
151 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  45.13 
 
 
176 aa  99  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  42.98 
 
 
139 aa  97.1  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  48.57 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  44.55 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  41.88 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  52.22 
 
 
130 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  43.93 
 
 
134 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  42.31 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  44.44 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  54.32 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  40.37 
 
 
135 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  42.98 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  42.73 
 
 
114 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  42.73 
 
 
114 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  39.6 
 
 
148 aa  84  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  37.62 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  48.39 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  48.28 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  47.19 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  37.86 
 
 
245 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  38.1 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  33.33 
 
 
220 aa  61.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  29.82 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  27.52 
 
 
252 aa  51.2  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  25.45 
 
 
224 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>