21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1654 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1654  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  254  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  32.14 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  34.55 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  32.32 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  34.19 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  30.09 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  26.53 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  32.32 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  32.69 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  27.18 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  29.31 
 
 
137 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  28.41 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  25.53 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  22.62 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>