More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3278 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  100 
 
 
339 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.42 
 
 
339 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  79.65 
 
 
339 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  76.99 
 
 
339 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  73.16 
 
 
339 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  61.38 
 
 
342 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  59.52 
 
 
338 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.36 
 
 
343 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.46 
 
 
343 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  58.08 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  56.34 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  59.46 
 
 
343 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.35 
 
 
345 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  56.89 
 
 
340 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  57.36 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  56.34 
 
 
339 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.06 
 
 
343 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  57.96 
 
 
334 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  51.62 
 
 
339 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  53.29 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  33.33 
 
 
385 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  33.03 
 
 
347 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.31 
 
 
322 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  33.93 
 
 
386 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  33.85 
 
 
331 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  33.13 
 
 
319 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  33.54 
 
 
331 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  33.04 
 
 
327 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  33.04 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  33.04 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  33.04 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  31 
 
 
327 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0462  MoxR family ATPase  33.12 
 
 
343 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  36.36 
 
 
336 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 
319 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.13 
 
 
343 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  31.58 
 
 
340 aa  153  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.35 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  33.43 
 
 
377 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  35.29 
 
 
318 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.01 
 
 
318 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.52 
 
 
321 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  34.67 
 
 
333 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  34.21 
 
 
318 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  32.34 
 
 
310 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  33 
 
 
308 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  32.39 
 
 
321 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  36.49 
 
 
324 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  34.37 
 
 
333 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  33.63 
 
 
337 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  34.37 
 
 
333 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.6 
 
 
356 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  34.23 
 
 
328 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.55 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  36.77 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  33.54 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  32.16 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  31.46 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.46 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  33.77 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.54 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.03 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  31.46 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  31.46 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  33.81 
 
 
359 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  31.61 
 
 
318 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.57 
 
 
331 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.21 
 
 
354 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  34.32 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  31.94 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  35.42 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  32.32 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  30.61 
 
 
309 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  31.67 
 
 
328 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  32.09 
 
 
321 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  31.15 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  35.4 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.54 
 
 
378 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  31.15 
 
 
335 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
313 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.14 
 
 
321 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  33.78 
 
 
325 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  32.13 
 
 
344 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  31.99 
 
 
318 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  32.22 
 
 
318 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  32.41 
 
 
318 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.4 
 
 
325 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  29.27 
 
 
332 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  33.53 
 
 
333 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  32.14 
 
 
326 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.35 
 
 
350 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  31.15 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  31.15 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  31.15 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  33.77 
 
 
345 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.63 
 
 
322 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.42 
 
 
333 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  32.54 
 
 
317 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  31.8 
 
 
318 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  31.58 
 
 
326 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>