294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2278 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  58.65 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  45.19 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  55.91 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  49.51 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  49.51 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  48.04 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  48.18 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  45.19 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  56.47 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  57.73 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  51.96 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30560  Ferredoxin  51.79 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  43.01 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  49 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.53 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.96 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  39.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.48 
 
 		 371 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  40.48 
 
 		 605 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  34.88 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  36.36 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  32.22 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  48.21 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.07 
 
 		 376 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.07 
 
 		 380 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3849  ferredoxin  66.67 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.05965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  33.33 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.08 
 
 		 349 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.83 
 
 		 407 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  40.48 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  40.48 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  40.48 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.25 
 
 		 367 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30 
 
 		 332 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 		 374 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  36.9 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.66 
 
 		 380 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.29 
 
 		 338 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  27.47 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  34.09 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.47 
 
 		 367 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  32.63 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.85 
 
 		 361 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  39.29 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  39.29 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  36.36 
 
 		 367 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  39.19 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.79 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.82 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33 
 
 		 342 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 		 383 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.83 
 
 		 848 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  41.51 
 
 		 336 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.98 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  44.83 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  34.69 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.83 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.08 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.38 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.83 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  39.44 
 
 		 365 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.08 
 
 		 345 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  34.88 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  34.88 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 354 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  34.88 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.14 
 
 		 349 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  34.88 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.65 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.07 
 
 		 928 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  30.85 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.06 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.06 
 
 		 406 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.44 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  35.14 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  30.12 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  30.53 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.95 
 
 		 340 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  35.71 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  38.1 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>