26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2596 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  237  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  34 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  34.65 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  36.67 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  34.83 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  29.06 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  42.59 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  38.89 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  28.28 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  27.96 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  32.63 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  45.61 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  29.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  41.51 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>