22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2264 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 259 aa  530  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  47.88 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  46.12 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  31.54 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  23.64 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  29.06 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  24.27 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  30 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  25.53 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0677  4-vinyl reductase 4VR  30.65 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  26.76 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  22.41 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1053  4-vinyl reductase 4VR  34.04 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1082  4-vinyl reductase 4VR  34.04 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0215  4-vinyl reductase 4VR  30.23 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  24.26 
 
 		 177 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  32.14 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  28.57 
 
 		 178 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3173  4-vinyl reductase 4VR  30.36 
 
 		 241 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0115584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>