60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2150 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2150  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1407  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  47.98 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000635421  normal  0.360925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0746  hypothetical protein  46.73 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1446  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  48.45 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.95951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0939  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  43.46 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1018  putative nucleotidyltransferase  38.54 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3457  putative nucleotidyltransferase  33.83 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2093  putative nucleotidyltransferase  32.62 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0142  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.75 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.854914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2497  GTP:adenosylcobinamide- phosphateguanylyltransfer ase  33.68 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0101489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2835  GTP:adenosylcobinamide-phosphateguanylyl transferase-like protein  31.25 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2088  putative nucleotidyltransferase  27.08 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1581  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  25.26 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0202  hypothetical protein  25.63 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.361982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0006  5'-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  30 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.318315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0722  nucleotidyl transferase  28.71 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.233715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0234  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  28.43 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0162  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.998873  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0989  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.4 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 449 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  32.58 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  32.08 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  29.32 
 
 		 362 aa  45.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.44 
 
 		 286 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  45.45 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0076  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  18.91 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.69 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  27.36 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1053  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.164178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2557  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.62 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0967265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  41.82 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.82 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2349  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  51.85 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0181385  hitchhiker  0.00000600969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1021  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.584106 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1086  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  0.292816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1102  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  23.88 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0994  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.892001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.45 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0778  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  37.25 
 
 		 255 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1530  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  24.39 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1190  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.37 
 
 		 294 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.0390929 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2725  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00922  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0340698  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  30.08 
 
 		 364 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00929  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0368176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1079  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00812749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2406  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00651954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2202  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173959  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2678  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0830301  normal  0.171534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1025  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 248 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0479651  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  32.93 
 
 		 278 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1473  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.45 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905305  normal  0.376761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1293  Nucleotidyl transferase  34.41 
 
 		 297 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  28.71 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.45 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0658  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.6 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.64009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0549  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.91 
 
 		 494 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.996934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.07 
 
 		 301 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.41 
 
 		 357 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>