17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2098 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  60.36 
 
 
237 aa  277  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  55.95 
 
 
246 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  54.3 
 
 
229 aa  266  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  56.64 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  47.86 
 
 
240 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  55.05 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  37.25 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  29.03 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  38.38 
 
 
180 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  33.01 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.14 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  22 
 
 
268 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  30.34 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.11 
 
 
175 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  31.43 
 
 
444 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  26.77 
 
 
124 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>