26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0271 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  951    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  45.21 
 
 
415 aa  296  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  45.23 
 
 
380 aa  276  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  40.99 
 
 
379 aa  259  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  39.64 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  36.68 
 
 
386 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  34.8 
 
 
459 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  38.12 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  37.65 
 
 
386 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  38.25 
 
 
422 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  37.39 
 
 
391 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  34.25 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  33.55 
 
 
459 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  36.31 
 
 
328 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  27.88 
 
 
405 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  26.58 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  26.58 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  26.67 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  26.92 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  32.67 
 
 
505 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  24.2 
 
 
431 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  24.78 
 
 
498 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  27.32 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  28.57 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  21.53 
 
 
389 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>