29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0158 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0158  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  870    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0408  hypothetical protein  45.43 
 
 
441 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2266  hypothetical protein  48.62 
 
 
458 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000113487  normal  0.0819386 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1586  hypothetical protein  39.95 
 
 
443 aa  332  9e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000507896  hitchhiker  0.00416523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0661  hypothetical protein  40.89 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000499977  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1941  hypothetical protein  30 
 
 
479 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000577788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1372  Protein of unknown function DUF516  30.56 
 
 
444 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2181  hypothetical protein  35.48 
 
 
306 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.175616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2934  Protein of unknown function DUF516  30.93 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0227101  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0227  Protein of unknown function DUF516  32.48 
 
 
273 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2781  Protein of unknown function DUF516  29.35 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2476  hypothetical protein  31.93 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0902  hypothetical protein  31.66 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.757817  normal  0.396557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0095  hypothetical protein  34.91 
 
 
267 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.342459  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0733  hypothetical protein  29.55 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00487772  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0054  Protein of unknown function DUF516  31.56 
 
 
238 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0231  hypothetical protein  27.55 
 
 
254 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0809  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0316  hypothetical protein  29.46 
 
 
254 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1669  hypothetical protein  26.79 
 
 
254 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.987983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0387  hypothetical protein  31.92 
 
 
258 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0773  hypothetical protein  33.14 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0774  hypothetical protein  26.24 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.0296069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1544  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0140701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0640  hypothetical protein  33.66 
 
 
252 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000906628  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1476  hypothetical protein  27.84 
 
 
252 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1672  hypothetical protein  30.65 
 
 
251 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000720356 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  30.34 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  55 
 
 
314 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>