36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8573 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8573  putative transposase  100 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  40.86 
 
 		 363 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  41.11 
 
 		 365 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  58.33 
 
 		 366 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.23 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40.23 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  39.08 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  39.08 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  39.74 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  64.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  40.23 
 
 		 376 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  34.48 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  63.33 
 
 		 754 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  46.67 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  41.67 
 
 		 362 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  44.44 
 
 		 356 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  44.44 
 
 		 356 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  55.88 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  52.94 
 
 		 374 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  63.64 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  63.64 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  63.64 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  60 
 
 		 362 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  60 
 
 		 362 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>