14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6283 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  76.45 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  76.16 
 
 		 334 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  72.92 
 
 		 303 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  50.52 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  35.15 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  35.23 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  35.23 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  35.23 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  29.08 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  27.38 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  25.95 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>