27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4993 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4993    100 
 
 		 104 bp  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  94.12 
 
 		 753 bp  95.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    91.94 
 
 		 752 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.31 
 
 		 189 bp  73.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    89.71 
 
 		 456 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    89.71 
 
 		 754 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  89.71 
 
 		 753 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    89.71 
 
 		 503 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    89.71 
 
 		 699 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 		 705 bp  67.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  88.24 
 
 		 753 bp  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    90 
 
 		 753 bp  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.24 
 
 		 960 bp  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    90.32 
 
 		 754 bp  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  88.24 
 
 		 753 bp  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    96.97 
 
 		 753 bp  58  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    88.41 
 
 		 972 bp  58  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  86.76 
 
 		 753 bp  56  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  87.5 
 
 		 753 bp  56  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    87.1 
 
 		 105 bp  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    87.1 
 
 		 243 bp  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    87.1 
 
 		 752 bp  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  94.12 
 
 		 753 bp  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  96.55 
 
 		 753 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  96.55 
 
 		 741 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  93.94 
 
 		 753 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    85.94 
 
 		 753 bp  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>