15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3716 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  71.14 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  33.44 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  38.87 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.69 
 
 		 3977 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.55 
 
 		 2346 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1001 aa  99  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  31.06 
 
 		 1089 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1231 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  32.77 
 
 		 1225 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  30.14 
 
 		 826 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  32.86 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  30.69 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>