14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3609 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  71.05 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5235  hypothetical protein  37.76 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  37.42 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  38.73 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  36.65 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  36.18 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  32.48 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  35.14 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  38.57 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  35.13 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1446  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000192739  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  31.87 
 
 		 352 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  31.32 
 
 		 352 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>