16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3586 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  79.14 
 
 
334 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  73.29 
 
 
345 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  66.22 
 
 
341 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  46.23 
 
 
381 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  38.25 
 
 
348 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  33.17 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  33.65 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  33.17 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  35.82 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  76.56 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  77.42 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  27.89 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  28.85 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  27.68 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>