19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3717 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  47.7 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  46.13 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  44.74 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  42.67 
 
 		 325 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  43.23 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  40.32 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  38.49 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  39.93 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  38.39 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  40.36 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  26.82 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  23.75 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  26.32 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  35.96 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  35.48 
 
 		 148 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  28.15 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  26.06 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>