38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2725 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2725  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  380  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4018  hypothetical protein  75.98 
 
 
184 aa  294  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0989  hypothetical protein  66.67 
 
 
181 aa  257  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0496  hypothetical protein  66.3 
 
 
176 aa  257  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6184  hypothetical protein  66.3 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71250  hypothetical protein  66.3 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5224  hypothetical protein  64.64 
 
 
176 aa  247  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.483414  normal  0.0264656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4783  hypothetical protein  64.09 
 
 
176 aa  244  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0904638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0395  hypothetical protein  64.09 
 
 
176 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4898  hypothetical protein  61.88 
 
 
176 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0309  hypothetical protein  61.88 
 
 
176 aa  237  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715579  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0330  hypothetical protein  61.33 
 
 
176 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531959  normal  0.713784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0332  hypothetical protein  61.33 
 
 
176 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.946324  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4495  4-vinyl reductase, 4VR  53.89 
 
 
177 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132465  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5020  4-vinyl reductase 4VR  53.89 
 
 
177 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0573  4-vinyl reductase, 4VR  53.89 
 
 
177 aa  188  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4820  4-vinyl reductase, 4VR  52.78 
 
 
177 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3285  4-vinyl reductase, 4VR  54.44 
 
 
177 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5202  4-vinyl reductase 4VR  54.44 
 
 
177 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5083  4-vinyl reductase, 4VR  54.44 
 
 
177 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3548  4-vinyl reductase 4VR  54.44 
 
 
177 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2109  V4R domain-containing protein  52.78 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02032  hypothetical protein  53.89 
 
 
177 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5065  4-vinyl reductase 4VR  52.78 
 
 
178 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899756  normal  0.0144061 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0708  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1977  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0742  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0830  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1004  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1583  hypothetical protein  52.22 
 
 
178 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00919835  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0473  hypothetical protein  52.78 
 
 
177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.712475  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5258  V4R domain-containing protein  52.54 
 
 
174 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.253966  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3301  4-vinyl reductase 4VR  51.96 
 
 
177 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382929  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1866  V4R domain-containing protein  52.51 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4052  V4R domain-containing protein  53.89 
 
 
200 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.194533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0862  4-vinyl reductase 4VR  44 
 
 
175 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  37.93 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0067  4-vinyl reductase 4VR  30.64 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>