74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2030 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  53.33 
 
 
183 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  53.33 
 
 
183 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  51.7 
 
 
189 aa  197  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  50.57 
 
 
202 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  47.46 
 
 
191 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  48.86 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  48.3 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  48.3 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  48.86 
 
 
183 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  49.71 
 
 
180 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  47.73 
 
 
184 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  47.16 
 
 
182 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  47.25 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  46.59 
 
 
182 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  46.59 
 
 
182 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  46.59 
 
 
182 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  47.4 
 
 
188 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  44.13 
 
 
186 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  45.6 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  45.45 
 
 
183 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  47.93 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  41.71 
 
 
207 aa  158  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  42.46 
 
 
181 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  43.83 
 
 
186 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  40.23 
 
 
183 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  43.53 
 
 
247 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  47.98 
 
 
182 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  37.79 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  40.83 
 
 
283 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  40.83 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  40.24 
 
 
207 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  40.24 
 
 
207 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  40.24 
 
 
207 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  40.24 
 
 
207 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  42.77 
 
 
201 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  40.24 
 
 
207 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  40.22 
 
 
190 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  43.45 
 
 
190 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  42.68 
 
 
203 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  40.57 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  42.68 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  41.42 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  39.88 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  42.68 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  40.7 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  42.68 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  42.26 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  39.88 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  36.21 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  39.31 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  36.72 
 
 
182 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  37.21 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  41.92 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  40 
 
 
194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  40.12 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  40.24 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  40.24 
 
 
190 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  41.88 
 
 
211 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  43.9 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  39.88 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  39.63 
 
 
206 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  43.11 
 
 
208 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  39.51 
 
 
191 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  41.42 
 
 
205 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  43.4 
 
 
249 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  38.75 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  39.33 
 
 
208 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  33.69 
 
 
288 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  42.45 
 
 
187 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  28.65 
 
 
170 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  26.55 
 
 
615 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5243  hypothetical protein  29.08 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>