35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0790 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0790  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000388685  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1497  protein of unknown function DUF1017  28.46 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000397908  normal  0.348491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0273  exported protein  27.07 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2879  hypothetical protein  28.46 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000994717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2522  hypothetical protein  28.05 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1341  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1406  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3008  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154991  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3158  polysaccharide synthesis-related protein  26.15 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1394  hypothetical protein  25.34 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  0.0357874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2862  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00254275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0233  hypothetical protein  25.22 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.739871  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2330  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  24.89 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000702109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1221  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000377582  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1095  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, YmcB  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2658  protein of unknown function DUF1017  24.89 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1101  hypothetical protein  24.89 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000190243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2611  hypothetical protein  24.89 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00988  hypothetical protein  25.44 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00995  hypothetical protein  25.44 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3969  protein of unknown function DUF1017  25.87 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4576  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4267  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4489  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5507  hypothetical protein  25.87 
 
 
220 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4415  hypothetical protein  24.66 
 
 
245 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0260723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03860  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03900  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4618  hypothetical protein  23.97 
 
 
245 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.36259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4566  hypothetical protein  23.97 
 
 
245 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.942521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4533  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4002  hypothetical protein  25.87 
 
 
245 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.413417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4481  hypothetical protein  23.97 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4566  hypothetical protein  23.97 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001790  hypothetical protein  25.71 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>