25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2755 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  76.83 
 
 
160 aa  264  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  73.17 
 
 
160 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  35.44 
 
 
185 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  40.26 
 
 
184 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  36.87 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  37.14 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  34.83 
 
 
188 aa  84  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.18 
 
 
180 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 
147 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.63 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  30.09 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  31.46 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.4 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  24.78 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  31.18 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>