23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2309 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 972 aa  1971    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 972 aa  1971    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 972 aa  1971    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  30.23 
 
 		 565 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  25.77 
 
 		 989 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  25.53 
 
 		 594 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  25.53 
 
 		 594 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 		 594 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 609 aa  132  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  25.68 
 
 		 602 aa  52.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 578 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  43.75 
 
 		 564 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 570 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 577 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  63.33 
 
 		 453 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  29.79 
 
 		 647 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.14 
 
 		 647 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  48.89 
 
 		 644 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  67.74 
 
 		 449 aa  45.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.14 
 
 		 647 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>