29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0998 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0998  putative signal transduction protein  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3688  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.73 
 
 		 505 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25.52 
 
 		 438 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  29.17 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.15 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.3 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.7 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  26.8 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.02 
 
 		 730 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  22.7 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  24.37 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 718 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  21.3 
 
 		 496 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  23.97 
 
 		 912 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  22.16 
 
 		 517 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  20.35 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  26.02 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>