19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1331 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  90.84 
 
 		 131 aa  242  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0236  SSU processome protein Utp24  93.89 
 
 		 131 aa  229  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0516612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  72.31 
 
 		 131 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  54.62 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60429  predicted protein  30.65 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0007968  normal  0.2488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  30.08 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15766  predicted protein  31.97 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03760  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10865  DUF652 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03340)  30.95 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27263  predicted protein  27.64 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  25.81 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  26.72 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  28.57 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  22.88 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  28.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  25 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  27.42 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  22.13 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>