27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1080 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  88.12 
 
 		 261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  85.06 
 
 		 261 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  61.69 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  48.66 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  28 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  27.78 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.56 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  29.27 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  30.81 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  26.4 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  29.94 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  28.14 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0829  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.62 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0242691  normal  0.504253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0680  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.62 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  28.76 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  24.47 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  24.56 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1441  hypothetical protein  24.89 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  26.77 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  26.09 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  29.58 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1442  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.45 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  25.89 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  28.65 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  33.04 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  26.47 
 
 		 285 aa  42  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>