24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0911 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0911  type II secretion system protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1642  type II secretion system protein  94.3 
 
 		 298 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.226081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1035  type II secretion system protein  94.63 
 
 		 298 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.124398 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1035  type II secretion system protein  78.86 
 
 		 298 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1152  type II secretion system protein  58.86 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1041  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1047  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1053  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.380793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.38 
 
 		 660 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.22 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  25.41 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.13 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  24.74 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.7 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  23.66 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  21.77 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>