34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2703 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  887    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  41.75 
 
 
479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  40.95 
 
 
472 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  45.23 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  40.19 
 
 
474 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  40.14 
 
 
481 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  45.39 
 
 
425 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  40.14 
 
 
481 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  40.14 
 
 
481 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  40.62 
 
 
474 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  40.1 
 
 
474 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  39.91 
 
 
481 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  42.51 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  40.9 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  40.67 
 
 
473 aa  307  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  39.62 
 
 
474 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  40.85 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  43.07 
 
 
461 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  41.5 
 
 
475 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  46.56 
 
 
443 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  46.03 
 
 
444 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  40.56 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  37.92 
 
 
409 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  35.22 
 
 
405 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  21.83 
 
 
406 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  22.59 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  22.59 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.91 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.68 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.78 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  25.14 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  22.97 
 
 
519 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  19.73 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>